Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms