Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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