Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFMBT1Q9UHJ3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms