Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms