Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms