Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM8A1Q9UBU6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM8A1Q9UBU6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM8A1Q9UBU6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM8A1Q9UBU6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM8A1Q9UBU6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM8A1Q9UBU6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM8A1Q9UBU6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM8A1Q9UBU6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM8A1Q9UBU6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM8A1Q9UBU6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM8A1Q9UBU6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms