Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPB1Q9UBR1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms