Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms