Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMLHEQ9NVH6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms