Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms