Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms