Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCM1Q9NP62 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms