Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6AQ9H2E6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEMA6AQ9H2E6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms