Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms