Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms