Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms