Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXQ1Q9C009 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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FOXQ1Q9C009 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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FOXQ1Q9C009 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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FOXQ1Q9C009 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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