Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YTHDF1Q9BYJ9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms