Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms