Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms