Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC22CQ9BRL7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms