Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms