Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFRSF13CQ96RJ3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms