Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms