Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
STAC3Q96MF2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAC3Q96MF2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAC3Q96MF2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAC3Q96MF2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAC3Q96MF2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAC3Q96MF2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAC3Q96MF2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
STAC3Q96MF2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAC3Q96MF2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAC3Q96MF2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAC3Q96MF2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAC3Q96MF2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms