Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms