Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPNQ96H22 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms