Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms