Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms