Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC12Q8WUD4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms