Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC191Q8NCU4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms