Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FSIP1Q8NA03 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms