Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00299Q6ZSB3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00299Q6ZSB3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms