Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms