Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms