Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM29Q5VYK3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms