Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDSS1Q5T2R2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms