Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms