Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

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Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBPF1Q3BBV0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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