Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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FOXD1Q16676 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
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FOXD1Q16676 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC084824.3-201ENST00000620472 856 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
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