Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms