Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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