Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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