Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC85BQ15834 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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