Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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