Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms