Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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ODF1Q14990 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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