Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms