Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCINQ13939 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCINQ13939 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCINQ13939 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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