Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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